上海轨道交通1号线 途径站点：莘庄（换乘5号线）外环路 莲花路 锦江乐园 上海南站（换乘3号线）漕宝路 上海体育馆 （换乘4号线）徐家汇（换乘9号线）衡山路 常熟路（换乘7号线）陕西南路（持公交卡在30分钟内出站换乘10号线） 黄陂南路 人民广场（换乘2、8号线）新闸路 汉中路 上海火车站（持公交卡在30分钟内出站换乘3、4号线）中山北路 延长路 上海马戏城 汶水路 彭浦新村 共康路 通河新村 呼兰路 共富新村 宝安公路 友谊西路 富锦路  另设梅陇车库和富锦路停车场 
上海轨道交通2号线 途径站点：徐泾东 虹桥火车站 虹桥2号航站楼 淞虹路 北新泾 威宁路 娄山关路 中山公园 （换乘3、4号线）江苏路（换乘11号线）静安寺（换乘7号线） 南京西路 人民广场（换乘1、8号线）南京东路（换乘10号线） 陆家嘴 东昌路 世纪大道（换乘4、6、9号线）上海科技馆 世纪公园 龙阳路（换乘7号线，出站转乘磁悬浮示范线）张江高科 金科路 广兰路（8节编组、4节编组换乘站）唐镇 创新中路 华夏东路 川沙 凌空路 远东大道 海天三路 浦东国际机场（换乘磁悬浮示范线）  另设龙阳路停车场（与7号线共享）和北翟路车辆段（与13号线共享）  另设石龙路停车场和江杨北路停车场
上海轨道交通3号线  途径站点：江扬北路 铁力路 友谊路 宝杨路 水产路 淞滨路 张华浜 淞发
路 长江南路 殷高西路 江湾镇 大柏树 赤峰路 虹口足球场（持公交卡在30分钟内出站换乘8号线）东宝兴路 宝山路（与4号线共站）上海火车站（与4号线共站，持公交卡在30分钟内出站换乘1号线）中潭路（与4号线共站）镇坪路（与4号线共站，换乘7号线）曹杨路（与4号线共站，换乘11号线）金沙江路（与4号线共站）中山公园（与4号线共站，换乘2号线）延安西路（与4号线共站）虹桥路（与4号线共站，换乘10号线）宜山路（换乘4、9号线）漕溪路 龙漕路 石龙路 上海南站（换乘1号线） 
上海东昌汽车上海轨道交通4号线 途经站点：宜山路（换乘3、9号线）上海体育馆（换乘1号线） 上海体育场 东安路（换乘7号线）大木桥路 鲁班路 西藏南路（换乘8号线）南浦大桥 塘桥 蓝村路（换乘6号线） 浦电路 世纪大道（换乘2、6、9号线） 浦东大道 杨树浦路 大连路 临平路 海伦路（换乘10号线） 宝山路（与3号线共站） 上海火车站（北广场）（与3号线共站，持公交卡在30分钟内出站换乘1号线）中潭路（与3号线共站） 镇坪路（与3号线共站，换乘7号线）曹杨路（与3号线共站，换乘11号线）金沙江路（与3号线共站） 中山公园（与3号线共站，换乘2号线）延安西路（与3号线共站）虹桥路（与3号线共站，换乘10号线））  另设蒲汇塘停车场  运营：上海地铁第三运营有限公司  其中虹桥路至宝山路共9个车站与轨道交通3号线共线运营。 
上海轨道交通5号线  东川路站（高架车站，与支线同站换乘）-----江川路站（高架车站，江川路口）----西渡站（高架车站，西度小学东侧）-------肖塘站（高架车站，大叶公路口）-----奉浦站（高架车站，韩村路口）-------环城东路站（地下车站，位于环城东路口）-------望园路站（地下车站，位于望园路团南公路以东大约70米）--------金海湖站（地下车站，浦南运河以北）--------南桥新城站（地下车站，位于百秀路口），--------平庄公路站（高架车站，金海公路之平庄公路西南侧）并2013年底通车。  另设平庄公路路停车场 
上海轨道交通6号线  途经站点：港城路（北起讫站）外高桥保税区北 航津路 外高桥保税区南 洲海路 五洲大道 东靖路 巨峰路 五莲路 博兴路 金桥路 云山路 德平路 北洋泾路 民生路 源深体育馆 世纪大道（换乘2、4、9号线）浦电路 蓝村路（换乘4号线）上海儿童医学中心 临沂新村 高科西路（换乘7号线）东明路 高青路 华夏西路 上南路 灵岩南路 东方体育中心（（南起讫站，换乘8号线）  另设港城路车辆段（与10号线共享）和三林停车场 
上海轨道交通7号线  途经站点：美兰湖 罗南新村 潘广路 刘行 顾村公园 祁华路（暂未开通） 上海大学 南陈路 上大路 场中路 大场镇 行知路 大华三路 新村路 岚皋路 镇平路（换乘3、4号线）长寿路 昌平路 静安寺（换乘2号线）常熟路（换乘1号线）肇嘉浜路（换乘9
号线）东安路（换乘4号线）船厂路 后滩 长清路 耀华路（换乘8号线）云台路 高科西路（换乘6号线）杨高南路 锦绣路 芳华路 龙阳路（换乘2号线，出站换乘磁悬浮示范线）花木路  另设锦秋路停车场和龙阳路停车场（与2号线共享）
上海轨道交通8号线  途经站点：市光路 嫩江路 翔殷路 黄兴公园 延吉中路 黄兴路 江浦路 鞍山新村 四平路（换乘10号线）曲阳路 虹口足球场（持公交卡在30分钟内出站换乘3号线）西藏北路 中兴路 曲阜路 人民广场（换乘1、2号线）大世界 老西门（换乘10号线）陆家浜路（换乘9号线）西藏南路（换乘4号线）周家渡（暂未开通）耀华路（换乘7号线）成山路 杨思 东方体育中心（换乘6号线） 凌兆新村 芦恒路 浦江镇 江月路 联航路 航天博物馆  另设殷行停车场 
上海轨道交通9号线  途经站点：松江新城 松江大学城 洞泾 佘山 泗泾 九亭 中春路 七宝 星中路 合川路 漕河泾开发区 桂林路 宜山路（换乘3、4号线）徐家汇（换乘1号线）肇嘉浜路（换乘7号线）嘉善路 打浦桥 马当路（换乘13号线）陆家浜路（换乘8号线）小南门 商城路 世纪大道（换乘2、4、6号线）杨高中路  另设九亭车辆段 
上海轨道交通10号线  途经站点：航中路 紫藤路 龙柏新村（航中路—龙柏新村为支线）虹桥火车站（换乘2号线）虹桥2号航站楼（换乘2号线）虹桥1号航站楼 上海动物园 龙溪路 水城路 伊犁路 宋园路 虹桥路（换乘3、4号线）交通大学 上海图书馆 陕西南路（持公交卡在30分钟内出站换乘1号线）新天地 老西门（换乘8号线）豫园 南京东路（换乘2号线）天潼路 四川北路 海伦路（换乘4号线） 邮电新村 四平路（换乘8号线）同济大学 国权路 五角场 江湾体育场 三门路 殷高东路 新江湾城  另设吴中路停车场。 
上海轨道交通11号线  途经站点：安亭 上海汽车城 昌吉东路（2011年4月26日开通）上海赛车场（支线安亭－上海赛车场）嘉定北 嘉定西 白银路 嘉定新城 马陆 南翔 桃浦新村 武威路 祁连山路 李子园 上海西站 真如 枫桥路 曹杨路（换乘3、4号线）隆德路 江苏路（换乘2号线）  12 
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（世博专线）
途经站点：马当路（换乘9号线） 卢浦大桥 世博大道